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End-to-end single-stranded DNA sequence design with all-atom structure reconstruction
本文提出了名为 InvDNA 的深度学习框架，通过端到端方式直接从原子坐标设计单链 DNA 序列并重建全原子结构，显著提升了序列恢复率及折叠成功率，克服了因结构数据稀缺导致的 ssDNA 设计瓶颈。
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310 篇论文
分子生物学探索着生命的核心密码，揭示基因如何运作、蛋白质怎样构建以及细胞如何交流。这一领域不再只是实验室里的深奥理论，而是理解疾病、开发新药甚至解读自身健康的关键。在 Gist.Science，我们致力于打破学术壁垒，让这些前沿发现触手可及。
本栏目收录的所有预印本均源自 bioRxiv。我们团队会逐一处理该分类下发布的最新预印本，为每一篇论文提供通俗易懂的科普解读与详尽的技术摘要，无论您是专业研究者还是科学爱好者，都能轻松掌握核心发现。
以下是该领域最新发布的预印本论文列表，欢迎浏览探索。
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Inferring Accumulation Times of Mitochondrial DNA Deletion Mutants from Cross-Sectional Single-Cell Data: Application to Tabula Muris Senis
本研究利用 Tabula Muris Senis 项目的单细胞转录组数据，通过随机建模框架量化了小鼠肌肉细胞中 mtDNA 缺失突变体的积累特征，揭示了特定基因区域的突变热点及其选择优势，并推断出这些突变从发生到主导细胞仅需约 3 个月的快速克隆扩张过程。
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Molecular characterization of chikungunya viruses associated with outbreaks in Kenya from 2017 to 2020
该研究通过分子特征分析和临床数据，揭示了2017至2020年肯尼亚莫桑比克和达达布 - 哈格德拉地区爆发的基孔肯雅病毒均属于印度洋谱系且携带增强蚊虫传播适应性的关键突变，同时明确了肌肉酸痛、头痛和惊厥是该病毒感染区别于其他急性发热疾病的显著临床预测因子。
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An Alport variant illuminates the bioactivity of the collagen IV α565- α121 scaffold in Bowman's capsule.
该研究通过对比将"Z-延伸”序列分别引入胶原 IVα3 和α5 亚基的小鼠模型，发现该变异仅在α5 亚基中诱导鲍曼囊基底膜显著增厚及α121 支架沉积，从而揭示了胶原 IVα565-α121 支架在鲍曼囊中具有独特的生物活性及其结构异常对组织病理的影响。
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Dosage compensation defects due to roX RNA deletion are rescued by recalibration of X/autosome stoichiometry
该研究发现，在果蝇雄性 S2 细胞中，虽然缺失 roX RNA 会导致剂量补偿复合物无法结合并激活 X 染色体基因，但细胞通过获得额外的 X 染色体（即改变 X/常染色体比例）来补偿表达失衡，而重新表达全长 roX2 则能恢复复合物结合并纠正染色体异常。
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Circadian immunometabolic states impart a temporal response to SARS-CoV-2 spike proteins in mammalian macrophages
该研究通过多组学分析发现，昼夜节律通过调控巨噬细胞的免疫代谢状态（而非经典免疫激活），使其对 SARS-CoV-2 刺突蛋白的响应在一天中呈现抑制与激活两种截然不同的时相特征。
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Evidence of Anopheles stephensi involvement in the transmission of Plasmodium vivax in Djibouti, 2024
这项 2024 年在吉布提进行的研究通过检测 196 只按蚊样本中的疟原虫孢子体和基因分析，确凿证实了入侵性媒介埃及伊蚊（Anopheles stephensi）是该国间日疟（Plasmodium vivax）传播的载体，并揭示了其种群与非洲之角其他地区的遗传关联，从而强调了采取紧急综合防控措施的重要性。
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Proteomic Signatures of Mitochondrial Dysfunction Associated with Atrial Fibrillation in Goats
该研究利用山羊房颤左心房组织的蛋白质组学数据，通过生物信息学分析揭示了线粒体功能障碍的特征，发现热休克蛋白 HSPA9 作为关键调控枢纽，协调了氧化磷酸化复合物 I 和 III 亚基的失调，表明房颤中线粒体存在整合能量产生、蛋白质稳态及呼吸链调控的系统性适应机制。
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Testing vivo-morpholino mediated gene knockdown in threespine stickleback
该研究首次在三刺鱼中测试了体内反义吗啉代寡核苷酸（vivo-MOs）介导的基因敲低技术，证实了该方法的可行性，但受限于注射递送的不稳定性，仅成功在脾脏中观察到 Spi1b 基因的显著敲低。
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The Structured RNA-binding Domains and Condensation Capacity of FUS Shape its RNA-binding Landscape and Function.
该研究利用定点突变将 FUS 蛋白的相分离能力与经典 RNA 结合功能解耦，揭示了其有序结构域识别特定序列基序与相分离增强结合 G 富集及结构化 RNA 的协同机制，从而阐明 FUS 如何通过整合这两种特性来调控核内凝聚体形成、DNA 损伤反应及基因表达。